Besedna zveza Modra Vrtnica (The Blue Rose) je v povezavi s Twin Peaksom prvič omenjena v celovečernim filmu Fire Walk With Me med preiskavo umora Terese Banks v mestecu Deer Meadow. Agent Chester Desmond svojemu partnerju zgolj namigne, da je Modra vrtnica nekaj zelo pomembna, vendar ne on – še manj pa film – nikoli ne pojasnita pravega pomena za omenjeno besedno zvezo. Šele tretja sezona nadaljevanke dokončno izpostavi ozadje Modre vrtnice; gre za posebno skupino, ki je nastala v 70. letih v sodelovanju med FBI in ameriško vojsko po uradni ukinitvi tajnega projekta Modra knjiga (Project Blue Book), katerega namen je bil raziskovanje morebitnih izvorov nezemeljskega življenja. Skupina je pravzaprav nadaljevala z delom omenjenega projekta, kar pomeni, da se je osredotočala na razreševanje težavnih primerov s področja paranormalnega. Skupino so sestavljali ustanovitelj Gordon Cole, vodja Phillip Jeffries ter agenti Desmond, Dale Cooper in Albert Rosenfield.
Zgodovina skupine Modra vrtnica je zelo zapletena in polna nerazrešenih vprašanj, vendar pa hkrati razkrije povezavo med agentom Cooperjem in njegovim prihodom v mesto Twin Peaks. Slednje je zbudilo pozornost vlade v času Projekta Modra Knjiga, pri katerem je sodeloval tudi major Briggs in prišel na sled nerazložljivim signalom iz vesolja, ki naj bi izhajali iz okoliških gozdov. Okoli leta 1985 se je Briggs začel intenzivneje ukvarjati z iskanjem prostora, imenovanega Bela loža. Ta dejavnost je zbudila pozornost Cooperjevega nekdanjega partnerja Windoma Earla, ki je bil eden od ključnih članov pri Projektu Modra knjiga, v 2. sezoni nadaljevanke pa je prispel v Twin Peaks z namenom, da bi odkril tako Belo kot Črno Ložo, ki predstavljata vir neskončne moči. Leta 1987 se zgodi prvi večji pretres v skupini Modra vrtnica; agent Jeffries med preiskavo primera v Buenos Aiersu izgine neznano kam. Ista usoda doleti tudi preostala člana skupine: leto dni kasneje med preiskavo umora Terese Banks izgine Chester Desmond, agent Cooper pa med preiskavo umora Laura Palmer. Oba umora sta bila obravnavana kot “modri vrtnici” ravno zaradi njune močne povezave z nadnaravnim.
25 let kasneje se skupini pridruži mlada agentka FBI Tammy Preston, saj tako Cole kot Rosenfield potrebujeta njeno pomoč pri iskanju pogrešanega agenta Cooperja. Lahko bi rekli, da je ravno tretja sezona posredovala vse potrebne informacije o Modri vrtnici; gre za nekakšno predhodnico famoznih Dosjejev X, ki na zaupen način razrešuje primere, ki sežejo onkrat meja racionalnega. Prav tako pa je skoraj gotovo, da se bodo člani Modre vrtnice vračali v Twin Peaks, ki je mesto polno lepot in skrivnosti.
